原子熒光的主要干擾是猝滅效應。這種干擾可采用減少溶液中其它干擾離子的濃度避免。

其它干擾因素有光譜干擾、化學干擾、物理干擾等。

克服干擾的途徑有加入絡合劑、降低硼qing化鉀濃度、加入氧化還原電位高于干擾離子的元素、分離干擾元素等方法。